学术合作
美国南伊利诺州大学与国立云林科技大学及国科会国家同步辐射研究中心签署LIGA技术研究合作。
国立云林科技大学校友张渊智先生在奈米材料研究成果发表，获奈米国家型科技计划商机探讨暨成果发表会壁报展第二名，并接受李远哲院长亲自颁奖，目前将与美国柏克莱大学前端先进奈米材料实验室共同开发研究。
云林科大积极发展应用科学-磁学及自旋电子科技，并延聘国际知名电子物理专家-帕肯博士，曾多次提名诺贝尔物理学奖的学者，积极邀约来校担任讲座教授，并参与教学与研究指导，设立研究中心且又获得美国、日本、韩国等国之研究团队之加入合作。
学术交流
云林科技大学缔约学校，仅列部分大学，如下：
中国大陆
哈尔滨工业大学、深圳大学、厦门大学、安徽大学、合肥工业大学、安徽工业大学、东北电力大学、陕西师范大学、中国石油大学（华东）、中国石油大学（北京）、北京大学（环境科学与工程学院）、北京理工大学、北京航空航天大学、北京科技大学、北京联合大学、天津大学、内蒙古科技大学、同济大学、宁波大学、华东理工大学、江苏科技大学。
日本
千叶大学、福井大学、琉球大学、大阪工业大学、神户艺术工科大学、未来大学、立命馆大学。
韩国
国立韩巴大学校。
越南
越南河内国家大学、越南河内经营管理大学、越南工业部机电工程学校、河内百科大学、越南外贸大学、越南国家大学下属科技大学、顺化大学工业工程学院、科技教育大学（越南胡志明市）、河内理工大学、工业工程学院（太原大学）、顺化大学 医学院、通讯科技学院、运通大学、侬南大学（越南胡志明市）、顺化大学 经济学院、河内土木工程大学、河内医学大学、国立经济大学、社会科学与人文大学（河内）、顺化大学 农林学院、越南国立大学 河内理工学院、太原大学（越南）等。
马来西亚
英豪多媒体传播学院、大山脚日新国民型中学、多媒体大学、新纪元学院、博特拉大学、拉曼大学。
泰国
国际科技大学、兰甘杏大学、亚洲理工学院。
印度
印度理工学院（坎布尔）、德里印度国家法律大学等。
菲律宾
圣马托斯大学、菲律宾大学。
俄罗斯
俄罗斯国立管理大学、莫斯科国立环境工程大学、莫斯科国立钢铁大学等。
荷兰
荷兰邓博契学院、荷兰乌特列支商学院等。
英国
帝蒙佛大学、伦敦都会大学等。
西班牙
瓦伦西亚理工大学等。
瑞士
吕勒奥理工大学等。
奥地利
奥地利格拉兹科技大学等。
丹麦
哥本哈根工程学院、Student Exchange PRogram at IHK。
法国
Ecole Superieure des Arts Appliques Groupe Ecole Superieure deCommerce de Troyes Champagne School of Managemen等。
德国
布兰登堡应用技术大学等。
美国
劳伦斯科技大学、匹兹堡州立大学、南伊利诺大学、爱克隆大学、内华达大学、辛辛那提大学、莱特州立大学、俄亥俄大学、华盛顿大学、罗得岛大学、西肯塔基大学
巴拿马
巴拿马科技大学
伯利兹
贝里斯大学
澳大利亚
国立旋滨大学、堪培拉大学、南澳大学。