院系专业
教育学院
教育学院各系所除设置日间大学部、硕士班、博士班外，也在该校进修暨推广部设置各类教学硕士专班和回流教育硕士专班，分别于夜间或暑假上课，提供在职进修机会。计有教育学系开设：学校行政硕士班、课程与教学硕士班、亲职教育硕士班、生命教育硕士班。体育学系开设：体育教学硕士班、体育硕士班。成人教育研究所开设：文教事业经营硕士班、组织发展与领导硕士班。辅导与谘商研究所开设：辅导与谘商硕士班。资讯教育研究所开设：资讯教育教学硕士班。人力资源与管理研究所开设：人力与知识管理硕士班。性别教育研究所是台湾第一个从事性别平等教育专业师资与实务工作者养成的高等学术研究单位。
教育学系：大学部、硕士班、博士班
特殊教育学系：大学部、硕士班、博士班
体育学系：大学部、硕士班
成人教育研究所：硕士班、博士班
辅导与谘商研究所：硕士班、博士班
资讯教育研究所：硕士班
性别教育研究所：硕士班、博士班
听力学与语言治疗研究所：硕士班
复健谘商研究所：硕士班
人力与知识管理研究所：硕士班
事业经营学系：大学部
科技管理研究所：硕士班
文学院
该校以迈向卓越为指标，为配合其他学院与行政单位之政策，文学院负有陶冶全校师生人文素养之重责大任。对港都高雄大都会及南部地区，负有推广服务、发扬人文精神的使命。 文学院有3系5所：国文学系（设有硕士、博士班）、英语学系（设有硕士、博士班）、地理学系（设有硕士、博士班）、台湾文化及语言研究所、华语文教学研究所、经学研究所、客家文化研究所、台湾历史研究所，数十年来，文学院无论日夜寒暑，始终弦歌不辍，已成为南部地区培育人文学科人才的重镇。
理学院
理学院各系、所课程的设计皆依系所特色、社会需求与未来发展做整体编排，采理论与实务并重。随着教育部师资培育政策改变，发展方向朝师资培育与非师资培育双轨分流，除保有原师资培育的特色外，各学系着手规划，课程结构模组化、学程化，仪器设备现代化、高效化，以强化学生专业知识，发展学生的多元化学习生涯。
在学术活动上，除鼓励系所教师争取研究计划并定期举办各类学术研讨会、专题演讲外更鼓励教师举办或赴国外参加相关领域之国际性研讨会并发表论著于各类期刊。
理学院设有数学系（含硕士班）、化学系（含硕士班）、物理学系（含硕、博士班）、生物科技系（含硕士班）、科学教育研究所（含硕、博士班）及环境教育研究所（硕士班）。
科技学院
配合学校发展成为综合大学的愿景，科技学院组合工业科技教育、工业设计、光电与通讯工程、电子工程、软体工程等5个学系，以及半导体设计研究所，试图开拓非师资培育的研究与教学领域，科技学院致力于规划、开设跨系学程，为学生提供多元化的学习领域。同时积极与企业结构、职业训练中心建立合作关系，强化学生进入职业市场的竞争力，并拓展国际交流管道，建立学生豁达的世界观。
艺术学院
2003年8月艺术学院奉准自文学院移出单独成立，同年11月改建源自工教大楼的艺术大楼正式启用，由美术系教授卢明德担任首任院长，第二任院长为陈瑞文教授，现任院长为黄久娟教授。系所包含美术学系所、音乐学系所、视觉设计学系所以及跨领域艺术研究所等单位。艺术学院开始整合院内外各种资源，并推动各项研究、教学、推广等相关活动，形成南部文化艺术教育发展重地。
艺术学院共有三系一所：
美术学系：大学部、硕士班
音乐学系：大学部、硕士班
视觉设计学系：大学部、硕士班
跨领域艺术研究所：硕士班