科研平台
截至2024年3月，学院学校拥有敦煌医学与转化教育部重点实验室，1个国际科技合作基地，1个省部共建协同创新中心，3个国家中医药管理局中医药科研三级实验室，5个甘肃省重点实验室，2个甘肃省临床医学研究中心（第二附属医院），1个甘肃省道地中药材种质资源库，5个厅局级中医药科研实验室（二级），2个甘肃省高校重点实验室，2个甘肃省高校人文社科重点研究基地，2个甘肃省高校新型智库，1个甘肃省高校产业研究院，1个甘肃省研究院，2个省级工程实验室，2个工程技术研究中心，1个省部级众创空间，1个实验动物省级行业技术中心，1个厅级协同创新中心，5个校级协同创新中心。
科研成果
截至2024年3月，近5年来，承担国家、省部级和其他科研课题1042项，以第一单位获得各类科研成果奖励93项，获国家专利159项。出版学术专著及教材533部，发表学术论文2746篇；第二附属医院拥有宣肺化浊颗粒、清肺通络颗粒等院内制剂130多个，姜石颗粒获评2022年“甘肃省药学发展奖”一等奖，“陇绿源”商标获批国家知识产权局商标注册。
馆藏资源
截至2024年3月，甘肃中医药大学图书馆馆藏纸质文献资源总量达98.6763万册，拥有各类数据库49个，纸质图书90余万册，电子图书249.5万册，电子期刊112.2万册。
截至2022年底，学院图书馆拥有图书馆自动化管理系统普通图书80.7271万，外文图书2.956万册，纸质期刊合订本4.327万册，纸质现刊504种，学位论文3450册，馆藏线装古籍2.4165万册，其中馆藏朝鲜内府刊《东医宝鉴》、元刻《(闻人氏)痘疹论》、明刻本《类经》等善本，台湾出版的《敦煌宝藏》、文渊阁影印本《四库全书》等，构成了本馆的古籍藏书特色；购置电子图书93.3163万余种，电子报纸250余种，电子期刊24.4572种，拥有各类数据库或平台共28个，包括， Springer电子数据库、Nature《自然》周刊、爱思唯尔（SD）电子期刊库、本地Pubmed、外文科技报告全文数据库、万方外文数据库等6个外文数据库：有千年医典-域外古籍丛书数据库、书同文—中医古籍大系数据库、爱如生—中医典海、甘肃中医药大学古籍特色库等4个古籍文献库；CNKI中国知网系列数据库、万方数据库、中国生物医学文献系统、百度文库、爱迪科森网上报告厅、中科医库、新东方多媒体学习库、维普考试资源系统、中医药系列知识服务平台、中药材图像数据库、中草药化学图像数据库、药用植物图像数据库等在内的各种类型中文数据库22个；拥有维普经纶知识发现系统、百链云图书馆、读秀学术搜索、维普论文检测系统、随书光盘系统、中医药趣味练习网上教学平台等学术搜索平台9个；书香中国互联网数字图书馆、移动图书馆、新东方掌上学习平台、微信图书馆等移动端APP 4个；自建甘肃中医药大学学位论文数据库、甘肃中医药大学古籍特色库2个，购置Endnote文献管理软件系统1套；共同构建起学科门类齐全，文本、图像、音频、视频等多种媒体互为补充，中西医文献为主、其他各类文献为辅、古籍文献为特色的立体交互式信息资源保障体系。
学术期刊
《中医儿科杂志》
《中医儿科杂志》是甘肃中医药大学和中华中医药学会主办的中医儿科专业杂志，是中华中医药学会系列期刊之一，入选“2022年度中国高校优秀科技期刊”；主要报道中医儿科临床、科研与教学成果，设有名家真传、专题笔谈、专家诊疗经验、理论研究、学术探讨、实验研究、教学研究、文献综述、临床研究与报道、针灸推拿、名院名科名医风采、经典古籍研究、儿童养生保健、医案医话、中药研究等栏目；已被《中国学术期刊综合评价数据库》《中国期刊全文数据库》、中国期刊网-中国学术期刊（光盘版）、《中国核心期刊（遴选）数据库》等多家大型数据库全文收录。
《甘肃中医药大学学报》
《甘肃中医药大学学报》是由甘肃省教育厅主管、甘肃中医药大学主办的中医药综合性学术刊物，是《CAJ-CD规范》执行优秀期刊，中国高校科技期刊优秀期刊；该刊设有专家诊疗经验、理论研究、学术探讨、学术争鸣、实验研究、临床研究与报道、针灸推拿、中药研究、工艺研究、技术与方法、教学研究、文献综述、百家园等栏目，并设有敦煌研究、藏医藏药、陇上医家、甘肃道地药材等具有地方特色的专栏；是“中国学术期刊综合评价数据库”统计源期刊、《中文科技资料目录——医药卫生》收录源期刊；被《中国核心期刊（遴选）数据库》《中国期刊全文数据库》《中国学术期刊综合评价数据库》等多家大型数据库收录。
《甘肃基层卫生》
《甘肃基层卫生》由甘肃中医药大学编印、甘肃省卫生健康委员会主管、甘肃省基层卫生协会主办的连续性内部资料出版物，被中国新闻出版研究院评为全国“优秀内部资料性出版物”。