科研平台
截至2023年11月，学校共有国家重大科研基础设施1个，国家重点实验室2个，国家临床医学研究中心2个，教育部重点实验室2个，教育部工程研究中心1个，国家中医药管理局重点研究室1个，国家中医药管理局中医药科研实验室（三级）2个以及其它省级重点实验室（研究中心）等。
研究成果
截至2023年11月，学校共获得各类科技成果奖千余项，其中国家自然科学奖1项、国家技术发明奖8项、国家科技进步奖59项、军事科学技术一等奖40项、军队医疗成果一等奖17项、省科学技术一等奖100项。“十一五”以来，共获“973”首席科学家项目8项，省部级以上科研项目4400余项，获批的各类科研经费总额超过28亿元。2008年至2011年连续4年荣获5项国家科技进步一等奖，2016年获国家科技进步奖创新团队奖，2020年再获国家科技进步一等奖。该校先后创造出百余项国内外“第一”或“唯一”的医学成就，世界首例“十指断离再植术”，世界首例“坑面女颌面再造术”，国内首例、世界第二例“换脸术”，国内首例“人子宫移植术”等，在国内外产生重大影响。
学校成功研发高原单兵增氧仪、非接触式生命探测仪、高性能战机飞行员生理心理检测系统等一大批新型卫生装备。特别是连续四年获得5项国家科技进步一等奖，在颌面战创伤救治、军人心理选拔、心脑血管保护、胃癌治疗、疼痛研究等方面取得重要突破，为提升全军卫生工作和战伤救治水平作出了新贡献。
2024年7月，空军军医大学病理学科研团队联合清华大学和商汤医疗共同发布了国内首个病理大模型——PathOrchestra。该模型基于国内规模最大的数字病理图像数据集训练，实现了全球最广泛的临床任务赋能，完成了人工智能病理研究领域从“单模专病”到“一模多病”的跨越式突破。
馆藏资源
截至2023年11月，学校图书馆占地12000平方米，有藏书74余万册，纸质期刊900余种，各类数据库60余个。该校拥有全球最大的国际口腔医学博物馆、国家级基础医学实验教学中心、国家级口腔医学虚拟仿真实验教学中心、人体解剖教学标本陈列馆；拥有虚拟实验教学系统、临床技能模拟训练系统、术中磁共振成像系统、手术机器人、PET/CT、PET/MR、螺旋断层放射治疗系统、立体定向放射治疗系统、磁共振引导聚焦超声治疗系统等大批先进的设施设备。
学术期刊
《空军军医大学学报》
本刊原刊名：《第四军医大学学报》、《医学争鸣》，月刊，是由空军军医大学主管、空军军医大学教研保障中心主办、面向国内外公开征稿和发行的高级综合性医药卫生类学术期刊，ISSN 2097-1656，CN 61-1526/R，邮发代码52-86。反映全校、全军、全国乃至世界医学科研、医疗、卫生防疫、教学等方面的新成果和新经验，促进学术交流和发展。内容包括军事医学、航空航天医学、军事预防医学、军事生物医学、军事心理学、基础医学、临床医学、口腔医学、中医中药学、药学等各方面的研究原著、研究快报、经验交流、文献综述、述评、争鸣、假说、学术探讨等各类学术论文。
《中华神经外科疾病研究杂志》
本刊为国内外发行的神经外科专业学术期刊，该杂志由第四军医大学主办，办刊宗旨为：贯彻党和国家卫生工作方针及政策，坚持理论与实践、普及与提高相结合的方式，反映全国及世界神经外科学的基础研究和临床技术的重大进展，促进国内、外神经外科学的学术交流。本刊主要涉及神经外科各类疾病的病因及病理、诊断与治疗方面，同时兼顾头颈外科、颌面外科、耳鼻咽喉科、神经影像学等学科的内容。本杂志为国际标准大16开本，105g进口铜版纸印刷，栏目设有述评、专家论坛、论著、论著摘要、经验交流、技术改进、短篇与个案、会议纪要、专题笔谈、讲座、综述、学术动态及教学园地等。
《牙体牙髓牙周病学杂志》
本刊是全国唯一的口腔内科学专科杂志，由第四军医大学口腔医学院主办，著名口腔医学专家史俊南教授主编。内容范围：龋病学、牙体修复学、牙髓病学、牙周病学、老年口腔医学、儿童口腔医学。本刊被国家科技部选为中国科技论文统计源期刊。为《中国科学引文数据库》、《中国学术期刊综合评价数据库》来源期刊。被《中国核心期刊（遴选）数据库》、《中国期刊网》、《中国学术期刊（光盘刊）》全文收录。曾获第二次全军医学期刊质量评比优秀编辑奖（1996）、陕西省优秀科技期刊一等奖（1999）、陕西省科技期刊优秀奖（2002）、第四次全军医学期刊质量评比I优秀期刊奖（2004）。读者对象为国内各口腔医学院、系、研究所；各口腔医院、口腔科；各卫生学校口腔专业的教学、医疗、科研人员、学生；各口腔诊所的医生。
《心脏杂志》
本刊于1989年2月创刊，1998年列入国家科委中国科技论文统计源期刊。2004年中国科技期刊引证报告《心脏杂志》的影响因子和被引频次位于同行业期刊的前1/3位。是国家科技部“中国科技论文统计源期刊”“中国科技核心期刊”“中文科技期刊数据库刊源”“《中国核心期刊（遴选）数据库》收录期刊，是具有ISSN/CN标准刊号的学术期刊。由空军军医大学、中国老年保健医学研究会心脏学会、中国医药信息学会心功能学会联合主办。由国内著名心血管专家担任顾问及编委。
《细胞与分子免疫学杂志》
本刊是由中国免疫学会和第四军医大学共同主办，为国内外公开发行的国家级科技期刊，属于全国中文核心期刊、中国科技论文统计源期刊、中国科学引文数据库源期刊及美国《CA》刊源。
《实用口腔医学杂志》
本刊是由第四军医大学口腔医学院主办，主编为著名口腔医学专家赵铱民教授。该刊于1985年11月创刊， 为双月刊，大16开全彩色印刷，正文128页。杂志自创刊起，始终坚持高标准、高质量、高学术水平的办刊宗旨，坚持高度的 政治责任心，在学术上，提倡创新、科学求实，坚持临床与基础相结合，普及与提高相结合。杂志以内容新颖、丰富、实用性强、 信息量大而深得读者的好评，在口腔医学界有较大的学术影响力及较高的知名度。该杂志已被国际著名检索系统——美国《化 学文摘》（CA）、《俄罗斯文摘杂志》（PЖ）、西太平洋地区医学索引（WPRIM）收录。国内已被国家科技部选入中国科技论文统计源期刊、被中国核心期刊要目总 览收录、中国科学院数据库源期刊、中国生物医学期刊源期刊。
《神经解剖学杂志》
本刊是由中国科学技术协会主管、中国解剖学会和第四军医大学主办、神经解剖学杂志编辑委员会编辑出版，国内外公开征稿和发行的高级学术期刊。它创刊于1985年10月，为双月刊，A4开本，铜版纸印刷，ISSN 1000-7547，CN 61-1061/R， 邮发代号52-214。本刊为中国科技核心期刊，中国基础与临床医学类核心期刊，中国自然科学类核心期刊，中国生物医学核心期刊；为中国学术期刊（光盘版）、中国期刊网、万方数据库、维普数据库全文收录期刊；美国化学文摘（CA）、波兰哥白尼索引（IC）、美国乌利希期刊指南（Ulrich IPD）、中国学术期刊综合评价数据库、中国科学引文数据库、中国科技论文统计源期刊；是中文核心期刊要目总览（2008）收录期刊，其影响因子和总被引频次均逐年上升。神经解剖学杂志为国家神经科学领域的纯学术刊物，反映中国及世界神经解剖学领域及其相关的基础和临床科研、医疗、卫生防疫等方面的最新成果和技术方法，刊登与神经解剖学相关的基础医学、临床医学、军事医学、口腔医学、航空航天医学、中医中药学、生物医学工程等学科的研究论著、研究快报、新技术方法、述评与综述等学术性论文。本刊将为促进神经科学界的学术交流、推动中国神经科学领域和国际水平接轨做出应有的贡献。