科研平台
截至2024年6月，重庆医科大学有有国家级、省部级研究平台77个，其中国家重点实验室、国家临床医学研究中心、国家工程研究中心、国家级国际科技合作基地等国家级平台7个，教育部重点实验室、教育部国际合作联合实验室、教育部省部共建协同创新中心及国家卫生健康委重点实验室等国家部委级平台8个；重庆市重点实验室、重庆市工程（技术）研究中心、重庆市临床医学研究中心、智库、科普基地等省级平台62个。直属附属医院获批国家临床研究中心和国家区域医疗中心各1个。
研究成果
截至2024年6月，重庆医科大学新增科技部、国家自然科学基金委等各级各类项目超过4500 项，资助经费约11亿元，牵头承担国家重点研发计划、科技创新 2030-重大项目、国家自然科学基金委等国家级重大重点项目54项，资助经费达2.38亿元。发表SCI收录论文10000余篇，年均增长率10%。多项成果在《柳叶刀》、《新英格兰医学杂志》、《细胞》、《美国医学会杂志》、《自然·医学》等国际顶级期刊发表。
截至2024年4月，重庆医科大学新增省部级以上科技奖励38项，包括重庆市科技奖一等奖5项，重庆市科技突出贡献奖1项。学校科技成果转化成效显著，独立研制的中国第一台具有完全自主知识产权的大型医疗设备——高强度聚焦超声肿瘤治疗系统（海扶刀）属世界首创，首台设备于2020年12月被中国国家博物馆收藏。学校研发的新冠病毒抗体和抗原检测产品为抗疫做出贡献，研发的具有自主知识产权的乙肝病毒核心相关抗原检测试剂盒已完成中试生产和注册检，即将进入临床试验。数字化病毒检测技术、抗抑郁和中风药物相关技术、肿瘤免疫治疗相关技术、阿尔兹海默症预防等科技成果高质量完成转化。
馆藏与电子资源
截至2024年6月，重庆医科大学有纸本图书221.7万册，电子图书499.8万册，订购有Nature、Elseiver、Springer、SCIE、Ebsco、Clinicalkey、Acland Anatomy、Cochrane Library、LWW Health Library、中国知网、万方、超星、牛津医学在线等80个国内外数据库；有馆藏书目数据库和领望随书光盘云系统。
学术期刊
《Genes & Diseases》
此刊创于2014 年9 月（季刊），2021年变更为双月刊。主要发表生物医学基础研究、医学临床基础研究、新技术、基础研究成果临床转化研究的科技成果。主要的文章类型有研究型论文、综述、快讯、新闻、评论、科研观察等。
《重庆医科大学学报》
1976年创刊（半年刊），1984年变更为季刊，2003年变更为双月刊，2007至今为月刊。主要登载临床、教学、科研工作者在医药科研领域中所取得的新理论、新成果、新经验、新技术、新方法；常设神经科学、内分泌、肿瘤等学科专题出版。
《中华医学教育探索杂志》
2002年创刊，常设教育研究、教学评价、教学改革、临床教学、精品课程建设、现代教育技术、国外医学教育、住院医师规范化培训、研究生教育、专科医师培训、护理教育研究、医学英语、医学与社会、医学伦理学、临床决策论坛、调查研究等栏目。