科研平台
据2024年11月学校官网数据，学校有教育部重点实验室2个，省级重点实验室7个，省级国际联合研究中心1个，省级工程研究中心3个，海口市重点实验室3个，省级医学临床研究中心2个，校级共享平台（科学实验中心）1个，衰老与肿瘤国际研究中心1个，海南医学院—香港大学联合热带传染病重点实验室1个，海南医学院全健康研究中心1个，海南省药物安全性评价研究中心1个，以及4个校级实验室；另有教育部重点实验室立项建设1个，国家卫健委重点实验室立项建设1个，教育部工程研究中心立项建设1个，省级医学临床研究中心立项建设5个，省级工程中心获批筹建5个，获批海南省院士工作站9个，院士创新中心8个。
科研成果
据2024年 学校官网数据，学校近5年获批国家自然科学基金项目283项，省部级科研项目431项；以第一作者或通讯作者在国内外学术刊物发表论文10593篇，其中被SCI收录3011篇，在《Cell》《Nature》《Science》刊物上发表论文4篇；获省部级及以上奖项36项，其中海南省自然科学奖、科学技术进步奖一等奖6项。
馆藏资源
截至2024年9月，海南医科大学图书馆占地面积约2.72万平方米，馆藏纸质文献122万余册，数字资源量1458万余册（含电子图书、电子期刊、学位论文、音视频资料），现报刊755种（期刊725种，报纸30种），中外文电子期刊45890种，中外文数字资源56种（中文数字资源24种，外文数字资源32种）。
学术刊物
截至2024年2月，学校主办6种学术期刊，分别为《亚太热带医药杂志：英文版》（Asian Pacific Journal of Tropical Medicine）、《亚太热带生物医学杂志（英文版）》（Asian Pacific Journal of Tropical Biomedicine）、《急性病杂志》（Journal of Acute Disease）、《亚太生殖杂志》（Asian Pacific Journal of Reproduction）、《全健康通报》（One Health Bulletin）、《海南医科大学学报（原海南医学院学报）》（Journal of Hainan Medical University ）。
《亚太热带医药杂志：英文版》（Asian Pacific Journal of Tropical Medicine）
月刊，由海南医科大学杂志社主办，海南医科大学主管，为SCI收录期刊。
《亚太热带生物医学杂志（英文版）》（Asian Pacific Journal of Tropical Biomedicine）
2011年创刊，月刊，由海南医科大学杂志社主办，海南医科大学主管；该刊已被Web of Science数据库、美国化学文摘、中科院分区（4区）、日本科学技术振兴机构数据库、PubMed生物医学检索系统、科学引文索引数据库、期刊引证报告（JCR_Q3）收录。
《急性病杂志》（Journal of Acute Disease）
双月刊，创刊于2012年，由海南医科大学与中华医学会急诊医学分会主办，Wolters Kluwer （威科）出版发行。该刊旨在为亚太地区及世界其他地区从事院前急救医学、急诊医学、危急重症医学医护人员和教育工作者提供学术成果传播和学术思想交流的平台。2016年被ESCI数据库收录，此外还被中国国内外多个数据库收录，包括美国剑桥科学文摘（CSA）、美国化学文摘（CA）、荷兰医学文摘（EM）、瑞典DOAJ开放获取数据库、俄罗斯OAJI开放数据数据库、万方、超星、百度学术等。
《亚太生殖杂志》（Asian Pacific Journal of Reproduction）
由海南医科大学主办，Wolters Kluwer（威科）出版发行，是经同行评审、开放性获取的国际英文期刊。主要刊登亚太地区的生殖领域的文章，如：生殖细胞与分子机制、生育和不孕不育、母胎医学、生殖内分泌学、生殖免疫学、生殖遗传学和遗传育种、辅助生殖技术、产前和着床前基因诊断、干细胞研究和遗传育种等。该刊已被多个国际数据库，如Scopus， ZR， CABI， Global Health， DOAJ， OAJI， IC， CAS， CSA， Google Scholar等收录。
《全健康通报》（One Health Bulletin）
季刊，由海南医科大学主办，旨在扩大人类、动物和环境卫生方面的跨学科合作与交流。该刊主要发表关于新出现的传染病、动物卫生、环境卫生、世界各地的做法和发展以及与公共卫生有关的其他学科的文章。
《海南医医科大学学报》（Journal of Hainan Medical University ）
1995年创刊，是海南医科大学主办、海南省教育厅主管的综合性医学期刊，半月刊，主要刊登有各类相关基金资助具有科学性、创新性、先进性、实用性的基础医学、临床医学、药学、公共卫生与预防医学、中医学等方面的学术论文，开辟有新型冠状病毒防控专栏、热带医学、黎族医药、亚太医学等特色栏目；本刊已被CA、CABI、CABA、CSA、UPD、DOAJ、JST、IC、HINARI、EBSCO等国际检索数据库和国际文摘收录；2009年获“首届海南省出版物政府奖”和“全国高校科技期刊优秀编辑质量奖”、获“海南省第二、三届优秀期刊”、获教育部科技发展中心评选的2012年、2014年、2015年“中国科技论文在线优秀期刊”二等奖以及2017、2018年蝉联“中国科技论文在线优秀期刊”一等奖等。